More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1111 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  100 
 
 		 321 aa  607  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  53.36 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  46.28 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  46.6 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  42.49 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  40.45 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  40.45 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  40.45 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  48.93 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  39.6 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  39.35 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  38.94 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  41.23 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1638  UspA domain protein  41.87 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  41.23 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.38 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  41.23 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  38.96 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  37.83 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.28 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  40.72 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  40.66 
 
 		 310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  36.39 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  39.41 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  36.04 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  40.19 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  37.95 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.64 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  39.61 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  39.61 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  40.07 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  39.61 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  39.81 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.71 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  35.38 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  39.2 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.07 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  35.08 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  35.08 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  36.96 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.58 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  36.45 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  39.26 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.65 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  40.53 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  43.42 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  39.81 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  37.15 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  39.41 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  40.33 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.8 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.67 
 
 		 284 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  35.12 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  36.07 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  36.7 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  41.08 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  38.59 
 
 		 283 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  37.46 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.48 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  35.91 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  39.03 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  36.51 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.36 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.18 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  38.71 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  39.81 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  38.71 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.98 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  33.97 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  35.61 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  35.76 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  37.33 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  34.73 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  34.73 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  37.7 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  41.07 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36.1 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.78 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.07 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  34.3 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  34.87 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>