More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1105 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
228 aa  450  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  53.62 
 
 
241 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  55.2 
 
 
232 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  53.1 
 
 
234 aa  204  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  49.1 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  43.58 
 
 
227 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  44.2 
 
 
221 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.27 
 
 
218 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  43.38 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  38.32 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  38.81 
 
 
219 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  37.04 
 
 
222 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  36.49 
 
 
149 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  31.4 
 
 
333 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.58 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.77 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.61 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.18 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  34.25 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  31.39 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  34.01 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  30.36 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.46 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 
149 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  35.19 
 
 
151 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  30.18 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  36.42 
 
 
339 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.24 
 
 
338 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  33.55 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  31.64 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  35.19 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  38.19 
 
 
427 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
428 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  36.42 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  35.53 
 
 
427 aa  75.5  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  30.14 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.6 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  33.51 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  32.67 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.52 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  31.19 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  28.82 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.21 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.24 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  33.53 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.29 
 
 
153 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  33.7 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.8 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  30.71 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  30.35 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  31.84 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.45 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.46 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  34.03 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  31.21 
 
 
426 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28.25 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.61 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.19 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  31.03 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.43 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  30.52 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  30.52 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  30.52 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  34.12 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.19 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  34.36 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  36.43 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.55 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  30.07 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  30.86 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  29.6 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30.82 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  29.81 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.82 
 
 
153 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
137 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.82 
 
 
153 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  42.36 
 
 
436 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 
154 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  33.33 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  39.6 
 
 
433 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0468  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  32.67 
 
 
150 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
149 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  30.82 
 
 
137 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>