More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1024 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  38.76 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  40.6 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  35.66 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  38.81 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  35.25 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  33.85 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  40 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  37.1 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  37.84 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  37.84 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  37.84 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  37.27 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  34.11 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  36.51 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  36.36 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  32.79 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  35.48 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  34.62 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  37.5 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.54 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  34.43 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  36.07 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  38.2 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  36.67 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  37.08 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  38.2 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  38.2 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  37.08 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  37.08 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  37.08 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  37.08 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  33.04 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  32.79 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  32.76 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  39.08 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  39.08 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  31.9 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  34.86 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  30.23 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1073  ferric uptake regulator, Fur family  31.52 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  34.44 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  32.46 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  29.46 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  29.27 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  34.83 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  28.68 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  32.95 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  39.33 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  32.95 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  30.58 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  32.95 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  27.13 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  34.07 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  32.11 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  32.5 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  32.54 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  28.35 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  27.56 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  32.29 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.25 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  28.12 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>