247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0993 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  61.32 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  58.13 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  53.23 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  53.23 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.82 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.82 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  57.09 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  50.61 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  53.04 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  53.28 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.02 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  48.98 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  52.02 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  52.02 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  52.42 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  50.2 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  55.91 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  48.41 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  47.37 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  51.63 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  54.09 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  47.37 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  48.02 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  51.02 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  57.8 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  55.35 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  51.43 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  47.13 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.63 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.39 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  51.64 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  47.01 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  47.01 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  49.8 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  49.8 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  51.22 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  51.22 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  51.22 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  46.12 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  48.19 
 
 		 250 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  43.25 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  54.84 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  53.39 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  42.21 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 		 402 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  46.22 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.04 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  42.23 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  58.96 
 
 		 137 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  40.16 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  42.86 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  40 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  38.68 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  41.38 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.15 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  46.35 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.09 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  40.54 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  43.54 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.63 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.74 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.6 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.3 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.07 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  34.62 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  32.72 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  40.14 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  33.17 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  33.84 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  33.49 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  37.93 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  34.1 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  32.43 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  31.86 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.87 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  30.45 
 
 		 340 aa  68.6  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  31.67 
 
 		 381 aa  68.6  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  31.19 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  34.88 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  31.08 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.17 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2013  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like  50 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.35 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  32.49 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>