186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0930 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 614 aa  1250    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  52.7 
 
 		 605 aa  548  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  42.11 
 
 		 596 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 566 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  43.48 
 
 		 494 aa  360  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  43.25 
 
 		 470 aa  343  7e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  39.9 
 
 		 612 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  37.46 
 
 		 589 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  38.92 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  41.21 
 
 		 688 aa  332  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  37.27 
 
 		 722 aa  327  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  39.5 
 
 		 679 aa  319  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  43.69 
 
 		 479 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  40.82 
 
 		 914 aa  309  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  37.77 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  36.79 
 
 		 722 aa  300  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  38.31 
 
 		 707 aa  287  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  35.73 
 
 		 528 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  38.06 
 
 		 551 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  34.47 
 
 		 738 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.3 
 
 		 2156 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.71 
 
 		 1888 aa  254  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  26.05 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  27.01 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  27.04 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  27.31 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  29.72 
 
 		 470 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  27.71 
 
 		 441 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  25.73 
 
 		 453 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 461 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  25.28 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  24.05 
 
 		 458 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.31 
 
 		 623 aa  94.4  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  22.54 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  21.03 
 
 		 739 aa  82  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  28.11 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.74 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  20.4 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  22.86 
 
 		 627 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.54 
 
 		 1891 aa  71.2  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.08 
 
 		 526 aa  70.1  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.18 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  21.72 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  51.35 
 
 		 644 aa  64.3  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  23.27 
 
 		 1021 aa  63.9  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  24.47 
 
 		 516 aa  63.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  36.11 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  21.64 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.62 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.28 
 
 		 814 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  22.38 
 
 		 555 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  22.49 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  23.18 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  22.13 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  39.08 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  21.12 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  42.17 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  23.99 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  22.82 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  22.1 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  23.22 
 
 		 488 aa  56.2  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  22.05 
 
 		 613 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.7 
 
 		 836 aa  54.7  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  22.05 
 
 		 613 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  24.47 
 
 		 521 aa  54.3  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  21.82 
 
 		 511 aa  54.3  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 524 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 484 aa  53.9  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.14 
 
 		 606 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.14 
 
 		 606 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 541 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  21.76 
 
 		 517 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  37.08 
 
 		 881 aa  51.2  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 		 426 aa  51.2  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  25.13 
 
 		 552 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  25.17 
 
 		 472 aa  51.2  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  21.48 
 
 		 742 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  24.92 
 
 		 549 aa  50.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  23.5 
 
 		 623 aa  50.4  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  24.86 
 
 		 752 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  24.63 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.36 
 
 		 1975 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  25 
 
 		 564 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  23.45 
 
 		 583 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  23.15 
 
 		 545 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  22.3 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  31.48 
 
 		 732 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  30.29 
 
 		 725 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1331  hypothetical protein  36.62 
 
 		 753 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  26.37 
 
 		 540 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  25 
 
 		 549 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  25 
 
 		 549 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 513 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  24.59 
 
 		 2638 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>