More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0913 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 326 aa  628  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.19 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  46.33 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  45.05 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.65 
 
 		 313 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  36.36 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  35.76 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  35.03 
 
 		 335 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  32.79 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  34.17 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.96 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  34.24 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.37 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  33.45 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  34.19 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.13 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  33.23 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.87 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  34.01 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  30.88 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  33.66 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  34.02 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  33.56 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  31.19 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  34.94 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  34.16 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  34.95 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33.22 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  32.78 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  30.1 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  35.2 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  32.62 
 
 		 297 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  34.2 
 
 		 321 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  31.03 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  31.33 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  31.33 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  32.41 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  32.41 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  32.52 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  33.99 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  31.79 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.83 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  33.22 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  33.67 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3207  hypothetical protein  33.22 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  32.4 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  34.02 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  34.02 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  34.02 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  34.98 
 
 		 307 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  31.8 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  34.02 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  34.02 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  34.02 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  32.66 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4953  hypothetical protein  32.87 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  29.86 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  30.98 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  31 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  33.9 
 
 		 322 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  29.8 
 
 		 300 aa  99.4  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  31.88 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  29.87 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  31.8 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  32.06 
 
 		 311 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  31.67 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  31.52 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  32.3 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  27.89 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  30.87 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  32.32 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  31.52 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.67 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.21 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  31.86 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  31.51 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  27.74 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.78 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  30.56 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  30.58 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  26.99 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  30.04 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  32.4 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0490  hypothetical protein  26.05 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>