More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0864 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
386 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  68.65 
 
 
368 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  65.41 
 
 
373 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  68.93 
 
 
385 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  65.86 
 
 
366 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  63.81 
 
 
386 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  63.81 
 
 
386 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  63.81 
 
 
386 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  63.88 
 
 
385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  61.87 
 
 
374 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  62.63 
 
 
373 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  65.22 
 
 
368 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  65.84 
 
 
363 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  60.27 
 
 
390 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  61.92 
 
 
380 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  59.2 
 
 
397 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  58.54 
 
 
369 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  60.31 
 
 
389 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  56.42 
 
 
398 aa  401  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  54.15 
 
 
425 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  56.3 
 
 
372 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  50.81 
 
 
372 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  51.09 
 
 
357 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  43.28 
 
 
367 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  49.34 
 
 
381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  50.91 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  51.71 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  60.08 
 
 
266 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  49.52 
 
 
483 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  44.66 
 
 
356 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  43.87 
 
 
389 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  43.5 
 
 
375 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  42.57 
 
 
421 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  44.56 
 
 
402 aa  243  5e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  41.98 
 
 
433 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  40.71 
 
 
323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  40.58 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  42.12 
 
 
360 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  38.94 
 
 
376 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  37.94 
 
 
318 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  39.31 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  37.09 
 
 
329 aa  199  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  37.93 
 
 
323 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  38.48 
 
 
388 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  38.97 
 
 
306 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  38.97 
 
 
306 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.85 
 
 
244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  35.43 
 
 
340 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.35 
 
 
248 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  33.78 
 
 
382 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.27 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  32.44 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  34.38 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  33.43 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.34 
 
 
240 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.4 
 
 
340 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.4 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  32.59 
 
 
398 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  33.52 
 
 
340 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.99 
 
 
372 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.17 
 
 
341 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  34.56 
 
 
332 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  36.57 
 
 
356 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.2 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  34.88 
 
 
341 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  35.94 
 
 
453 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  34.59 
 
 
338 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  34.69 
 
 
370 aa  152  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  35.07 
 
 
331 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  34.28 
 
 
339 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  34.39 
 
 
315 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  33.99 
 
 
343 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  33.99 
 
 
343 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  35.55 
 
 
323 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  34.27 
 
 
342 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30.31 
 
 
400 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  35.55 
 
 
323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  32.29 
 
 
346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  36 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  34.16 
 
 
327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  33.91 
 
 
329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  45.45 
 
 
338 aa  147  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.41 
 
 
242 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  30.97 
 
 
319 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  31.52 
 
 
365 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  34.21 
 
 
362 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.52 
 
 
242 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  33.72 
 
 
323 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.36 
 
 
233 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.34 
 
 
243 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  49.07 
 
 
228 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  34.6 
 
 
342 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  34.12 
 
 
341 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  34.6 
 
 
341 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  34.6 
 
 
341 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  34.6 
 
 
341 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.09 
 
 
230 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  32.96 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.86 
 
 
250 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>