145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0817 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
548 aa  1061    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  52.45 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  47.82 
 
 
542 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  48.19 
 
 
554 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  43.11 
 
 
578 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  45.01 
 
 
536 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  40.93 
 
 
582 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  35.6 
 
 
602 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  26.73 
 
 
599 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  27.56 
 
 
592 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  26.24 
 
 
596 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  26.24 
 
 
596 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  27.39 
 
 
595 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  26.6 
 
 
592 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  26.24 
 
 
596 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  25.62 
 
 
609 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  26.68 
 
 
591 aa  207  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  25.8 
 
 
590 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  26.29 
 
 
592 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  26.76 
 
 
590 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  26.76 
 
 
590 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  26.94 
 
 
590 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  26.58 
 
 
590 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  26.42 
 
 
590 aa  200  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  30.02 
 
 
635 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  26.49 
 
 
542 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  25.45 
 
 
575 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  25.95 
 
 
581 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  31.37 
 
 
543 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  28.4 
 
 
540 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  27.22 
 
 
628 aa  87.8  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  28.5 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  28 
 
 
502 aa  71.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  29.17 
 
 
506 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  32.77 
 
 
544 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  26.5 
 
 
622 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  25.42 
 
 
614 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  25.42 
 
 
614 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  25.42 
 
 
227 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  25.42 
 
 
614 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  26.35 
 
 
611 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  26.52 
 
 
629 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  24.86 
 
 
607 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  24.7 
 
 
614 aa  61.6  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0262  hypothetical protein  24.09 
 
 
621 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  24.86 
 
 
607 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  24.86 
 
 
607 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  27.59 
 
 
628 aa  61.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  28.31 
 
 
1283 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1442  protein of unknown function DUF885  26.09 
 
 
594 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  24.86 
 
 
617 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  23.26 
 
 
589 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  26.04 
 
 
608 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3863  protein of unknown function DUF885  25.96 
 
 
600 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.292852  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  21.34 
 
 
585 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02810  hypothetical protein  26.12 
 
 
596 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  27.71 
 
 
625 aa  57.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  24.07 
 
 
587 aa  57.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  28.81 
 
 
496 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  27.11 
 
 
614 aa  57.4  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  27.61 
 
 
593 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  27.79 
 
 
543 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  27.57 
 
 
522 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  25.15 
 
 
618 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  24.1 
 
 
602 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  24.85 
 
 
617 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5570  protein of unknown function DUF885  20.65 
 
 
564 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000119497  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  25 
 
 
613 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  27.33 
 
 
625 aa  53.5  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  24.54 
 
 
613 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  25.9 
 
 
609 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  27.49 
 
 
593 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  23.45 
 
 
592 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  23.26 
 
 
624 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  27.65 
 
 
628 aa  50.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2038  hypothetical protein  28.17 
 
 
579 aa  50.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  26.63 
 
 
616 aa  50.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  22.86 
 
 
616 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  24.95 
 
 
558 aa  50.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  25.15 
 
 
609 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  28.16 
 
 
621 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  25.14 
 
 
617 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  29.87 
 
 
577 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  27.81 
 
 
609 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  27.33 
 
 
609 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  29.52 
 
 
561 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  26.04 
 
 
605 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  23.7 
 
 
618 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  26.9 
 
 
586 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  27.33 
 
 
609 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  27.33 
 
 
609 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  26.04 
 
 
616 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  27.33 
 
 
609 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  27.06 
 
 
633 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  27.33 
 
 
609 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  24.39 
 
 
619 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  26.69 
 
 
537 aa  48.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  27.11 
 
 
589 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  26.74 
 
 
611 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  22.45 
 
 
616 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>