More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0809 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
344 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  63.02 
 
 
340 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  56.42 
 
 
339 aa  348  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  56.21 
 
 
340 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  56.25 
 
 
338 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  55.49 
 
 
348 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  55.62 
 
 
335 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  54.01 
 
 
348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  53.1 
 
 
331 aa  309  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  51.79 
 
 
335 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  51.19 
 
 
335 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  50.89 
 
 
331 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  51.18 
 
 
339 aa  296  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  49.42 
 
 
345 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  50.3 
 
 
473 aa  292  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  48.95 
 
 
346 aa  288  9e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  52.63 
 
 
339 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  51.03 
 
 
344 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  50.81 
 
 
338 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  48.2 
 
 
343 aa  276  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  48.07 
 
 
343 aa  272  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  47.48 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  50 
 
 
351 aa  268  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  46.13 
 
 
337 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  48.8 
 
 
351 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  47.67 
 
 
350 aa  261  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  45.24 
 
 
337 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  47.75 
 
 
337 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  46.57 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  47.88 
 
 
349 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  45.32 
 
 
350 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  45.86 
 
 
343 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  42.26 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  42.27 
 
 
338 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  44.81 
 
 
342 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  39.46 
 
 
340 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  44.21 
 
 
359 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  42.86 
 
 
357 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.81 
 
 
336 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  45.06 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  39.29 
 
 
348 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  35.44 
 
 
337 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.87 
 
 
353 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  34.24 
 
 
338 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 
341 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  37.24 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  36.77 
 
 
339 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  40.65 
 
 
335 aa  199  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 
332 aa  198  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.88 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  32.73 
 
 
342 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.13 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.13 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 
333 aa  196  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 
336 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  37.82 
 
 
358 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 
333 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  35.42 
 
 
328 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 
341 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  39.3 
 
 
382 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.9 
 
 
341 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 
334 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  38.35 
 
 
339 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  36.61 
 
 
341 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 
341 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 
338 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  192  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  192  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  36.61 
 
 
341 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.61 
 
 
341 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.82 
 
 
342 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 
333 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 
339 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.33 
 
 
341 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  36.91 
 
 
333 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  41.79 
 
 
337 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  37.28 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.15 
 
 
386 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 
330 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  36.96 
 
 
332 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.83 
 
 
342 aa  188  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  36.96 
 
 
332 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 
341 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  36.96 
 
 
332 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 
336 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 
341 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  36.96 
 
 
332 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>