More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0782 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 220 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  76.96 
 
 		 226 aa  318  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.36 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  69.44 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.91 
 
 		 217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.55 
 
 		 215 aa  257  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.13 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.2 
 
 		 220 aa  237  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.3 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.21 
 
 		 230 aa  208  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.36 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  53.02 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  56.42 
 
 		 221 aa  201  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  52.09 
 
 		 215 aa  201  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  49.3 
 
 		 218 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.87 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  49.3 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.77 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  51.4 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.64 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.36 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  50.93 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.82 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  50.69 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  49.09 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  44.76 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.36 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  47.32 
 
 		 227 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 239 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  48.61 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  51.38 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  50 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.64 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4067  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.352272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.85 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  48.37 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.29 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.87 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  48.6 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  49.08 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  48.17 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.26 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.85 
 
 		 241 aa  177  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  45.66 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  45 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 210 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  44.34 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.51 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.43 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.84 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  50 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>