251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0744 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 
268 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  60.7 
 
 
366 aa  299  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  58.92 
 
 
243 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  57.02 
 
 
254 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  58.99 
 
 
224 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  56.4 
 
 
221 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  47.86 
 
 
274 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  49.59 
 
 
249 aa  238  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  53.14 
 
 
225 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  46.85 
 
 
262 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  50.42 
 
 
250 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  55.83 
 
 
218 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  49.79 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  46.83 
 
 
246 aa  214  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  43.49 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  46.99 
 
 
243 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  46.12 
 
 
276 aa  204  8e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  45.02 
 
 
250 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  47.37 
 
 
225 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  45.68 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  45.68 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  45.68 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  46.78 
 
 
243 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  46.41 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  47.19 
 
 
239 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  44.76 
 
 
270 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  44.02 
 
 
314 aa  181  9.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  40.91 
 
 
242 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  41.77 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  45.67 
 
 
285 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  43.75 
 
 
218 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  41.67 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  40.85 
 
 
225 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  39.47 
 
 
270 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  39.47 
 
 
270 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  44.93 
 
 
235 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  47.64 
 
 
216 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  47.59 
 
 
224 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  42.16 
 
 
218 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  45.27 
 
 
219 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  44.31 
 
 
200 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 
219 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 
219 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  40.89 
 
 
217 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  40.19 
 
 
225 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  37.61 
 
 
232 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  47.21 
 
 
217 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  43.55 
 
 
192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 
215 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  36.49 
 
 
215 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  36.41 
 
 
215 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 
215 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  36.89 
 
 
215 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  42.93 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  42.93 
 
 
195 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  35.92 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  35.92 
 
 
215 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  35.44 
 
 
215 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  35.44 
 
 
215 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  36.74 
 
 
216 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  35.92 
 
 
215 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  36.28 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  46.43 
 
 
213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  41.44 
 
 
215 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  36.32 
 
 
215 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  40.72 
 
 
208 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  37.5 
 
 
214 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  33.66 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  33.82 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  40.59 
 
 
214 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  32 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  39.66 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  34.31 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  31.84 
 
 
220 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  37.43 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  32.51 
 
 
239 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  35.05 
 
 
209 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  32.74 
 
 
219 aa  106  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  36.21 
 
 
226 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  31.86 
 
 
208 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 
216 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  36.72 
 
 
230 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  36.21 
 
 
226 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  38.14 
 
 
214 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  28.63 
 
 
257 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  37.04 
 
 
214 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  38.14 
 
 
214 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  33.82 
 
 
205 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  35.29 
 
 
236 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  32.61 
 
 
215 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  34.76 
 
 
220 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  39.31 
 
 
205 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  34.68 
 
 
215 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0618  hemolysin III-like protein  34.3 
 
 
225 aa  99.4  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.160524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  31.63 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  30.17 
 
 
228 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  31.88 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  33.33 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  30.96 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>