More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0708 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 162 aa  323  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  83.78 
 
 		 155 aa  259  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  70.59 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  69.23 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  66.44 
 
 		 153 aa  197  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  64.2 
 
 		 164 aa  197  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  66 
 
 		 149 aa  197  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  65.13 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  61.96 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  61.39 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  65.31 
 
 		 150 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  61.84 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  63.27 
 
 		 153 aa  184  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  59.87 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  59.49 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  61.07 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  61.07 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  61.07 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  60.54 
 
 		 151 aa  181  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  59.33 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  60.4 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  54.27 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  64.63 
 
 		 150 aa  175  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  61.15 
 
 		 186 aa  174  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  58.55 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  56.25 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  57.52 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  58.55 
 
 		 187 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  55.56 
 
 		 170 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  53.99 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  52.12 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  59.06 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  54.42 
 
 		 186 aa  157  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  59.06 
 
 		 179 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  54.42 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.06 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  51.02 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.79 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  38.26 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  45.13 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  45.13 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  42.45 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  41.14 
 
 		 301 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  36.91 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  42.38 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.05 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  41.88 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  43.1 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  45.26 
 
 		 142 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  41.13 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.71 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  32.28 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  39.39 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  40.18 
 
 		 446 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  39.55 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  35.62 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  30.57 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  38.19 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  36 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  36.99 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  36.99 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  36.22 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  36.99 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  36.99 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  30 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  37.38 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  36.99 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  36.99 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  36.99 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  39.02 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  40.74 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  40.74 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  41.07 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  41.07 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  44.79 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  33.54 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  32.52 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  27.41 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  40.68 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  31.2 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  44.12 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  30.34 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  45.65 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35.29 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  41.59 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>