More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0674 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  100 
 
 
421 aa  834    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  51.82 
 
 
423 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  44.36 
 
 
420 aa  338  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  41.39 
 
 
422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.62 
 
 
410 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.62 
 
 
411 aa  259  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.21 
 
 
405 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.61 
 
 
412 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.41 
 
 
411 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.1 
 
 
411 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.1 
 
 
411 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.62 
 
 
411 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.08 
 
 
411 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.1 
 
 
411 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.1 
 
 
411 aa  245  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  35.1 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.1 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.62 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.22 
 
 
400 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  40.35 
 
 
403 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.66 
 
 
411 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.76 
 
 
398 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.86 
 
 
411 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  39.75 
 
 
401 aa  229  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.15 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.05 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.33 
 
 
420 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.29 
 
 
414 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  40.5 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  42.66 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.2 
 
 
426 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.69 
 
 
408 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.99 
 
 
399 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.38 
 
 
402 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.07 
 
 
407 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.54 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.16 
 
 
401 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  40.76 
 
 
402 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.21 
 
 
410 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  38.26 
 
 
418 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.79 
 
 
400 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.81 
 
 
419 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  39.39 
 
 
394 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  36.95 
 
 
399 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.56 
 
 
400 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  37.56 
 
 
464 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.57 
 
 
398 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  38.18 
 
 
404 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  40.13 
 
 
410 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  39.48 
 
 
367 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  41.27 
 
 
409 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  39.56 
 
 
398 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  40.72 
 
 
405 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  36.67 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  43.5 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  42.76 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  39.89 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  35.56 
 
 
400 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  38.1 
 
 
405 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.39 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  40.88 
 
 
459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  40 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  36.6 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  34.97 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  35.53 
 
 
404 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  34.75 
 
 
400 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  42.9 
 
 
444 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.38 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  42.68 
 
 
366 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.41 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.94 
 
 
407 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.94 
 
 
407 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.09 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  40 
 
 
412 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.77 
 
 
417 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  36.25 
 
 
399 aa  196  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.36 
 
 
391 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  39.37 
 
 
411 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34 
 
 
399 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.46 
 
 
436 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  41.77 
 
 
447 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  41.77 
 
 
447 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  41.77 
 
 
447 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  37.4 
 
 
417 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  35.08 
 
 
395 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  38.49 
 
 
408 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.53 
 
 
406 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  32.68 
 
 
408 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  36.23 
 
 
443 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  35.07 
 
 
396 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  35.62 
 
 
406 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.22 
 
 
392 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  33.72 
 
 
417 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  41.41 
 
 
404 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7442  Cytochrome P450-like protein  38.32 
 
 
571 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  40.66 
 
 
411 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  39.87 
 
 
373 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.52 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  35.92 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  35 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>