More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0638 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
446 aa  905    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  64.17 
 
 
442 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  60.54 
 
 
433 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  60.23 
 
 
442 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  59.95 
 
 
447 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  59.82 
 
 
468 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  58.69 
 
 
437 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  60.82 
 
 
446 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  60.92 
 
 
444 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  60.82 
 
 
444 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  57.68 
 
 
487 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  59.51 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  55.01 
 
 
506 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  51.83 
 
 
437 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  50.45 
 
 
436 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  50.45 
 
 
436 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  50.45 
 
 
436 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  50.23 
 
 
425 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  51.8 
 
 
442 aa  368  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  49.89 
 
 
448 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  49.77 
 
 
429 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  44.49 
 
 
446 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  38.08 
 
 
766 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  36.59 
 
 
412 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  34.78 
 
 
416 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
416 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  36.28 
 
 
417 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  40.18 
 
 
424 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  33.26 
 
 
436 aa  236  9e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  30.35 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  35.28 
 
 
414 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  35.96 
 
 
374 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  34.51 
 
 
374 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  32.38 
 
 
439 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  34.34 
 
 
374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  32.24 
 
 
447 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  33.64 
 
 
429 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  32.81 
 
 
428 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  32.2 
 
 
430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  33.64 
 
 
412 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  31.69 
 
 
423 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  33.74 
 
 
430 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  32.6 
 
 
423 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  34.15 
 
 
432 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  33.87 
 
 
429 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  33.63 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  31.63 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  32.52 
 
 
428 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  31.71 
 
 
427 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  33.1 
 
 
423 aa  159  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  32.94 
 
 
437 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  29.89 
 
 
438 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  31.22 
 
 
437 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  35.45 
 
 
819 aa  156  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  30.54 
 
 
408 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  31.19 
 
 
386 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  29.45 
 
 
432 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  33.04 
 
 
434 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  32.21 
 
 
441 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  30.81 
 
 
415 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  28.87 
 
 
420 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  30.86 
 
 
418 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  30.99 
 
 
426 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  31.84 
 
 
433 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  31.14 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  32.96 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  30.71 
 
 
459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  29.32 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  31.89 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  33.03 
 
 
453 aa  147  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  28.85 
 
 
437 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  32.8 
 
 
453 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  33.49 
 
 
429 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  32.31 
 
 
455 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  32.63 
 
 
425 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  30.65 
 
 
425 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  33.1 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  32.94 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  29.69 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  32.33 
 
 
415 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  29.02 
 
 
418 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  31.24 
 
 
425 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  32.54 
 
 
415 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  30.5 
 
 
404 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  28.28 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  27.78 
 
 
398 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  29.73 
 
 
420 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  33.65 
 
 
411 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  29.69 
 
 
430 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  32.1 
 
 
415 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  29.48 
 
 
420 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  31.44 
 
 
433 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  30.93 
 
 
470 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  30.19 
 
 
419 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  29.23 
 
 
418 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25.89 
 
 
427 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  31.36 
 
 
723 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  32 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>