More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0606 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 231 aa  456  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  65.47 
 
 		 224 aa  279  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  63.26 
 
 		 239 aa  254  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  44.19 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.85 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  42.27 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  43.58 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  42.08 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.8 
 
 		 241 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  44.22 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  41.55 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  41.07 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  41.1 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  45.45 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  40.19 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  44.85 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.29 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  37.5 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  36.59 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  39.05 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  44.1 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  35.24 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  43.15 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  36.06 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  36.95 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  37.2 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  39.16 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  35.44 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  45.62 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  39.43 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  38.55 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 201 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  33.01 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  33.16 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  38.55 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.68 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  34.55 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  35.64 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.68 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  42.38 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  35.91 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  32.04 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  31.71 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.25 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  32.85 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  33.17 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  33 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.12 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  32.24 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  33.66 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  30.35 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  37.3 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  37.84 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  34.86 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  35.35 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  35.35 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  34.21 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  35.09 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  33.02 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  33.33 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 		 207 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  34.85 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  28.64 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  30.35 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  39.1 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.18 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  31.75 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  30.2 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  31.19 
 
 		 202 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  33.73 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  36.26 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.57 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  35.56 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  34.97 
 
 		 203 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  32.4 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  35 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  30.38 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  35.36 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  35.36 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.01 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  31.41 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.17 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  31.16 
 
 		 202 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.67 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.32 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  30.2 
 
 		 202 aa  92.4  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  33.94 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  38.57 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  38.57 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  38.69 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  38.57 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  38.57 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  37.42 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  34.81 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 197 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  35.88 
 
 		 178 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>