More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0580 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
399 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  68.48 
 
 
426 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  62.08 
 
 
402 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  56.74 
 
 
399 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  57.18 
 
 
426 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  50.26 
 
 
800 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  50.5 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  41.12 
 
 
397 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  36.62 
 
 
388 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  40.21 
 
 
398 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  41.42 
 
 
406 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
392 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
392 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  34.22 
 
 
432 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
398 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
367 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
402 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
389 aa  143  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
387 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
430 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  34.62 
 
 
377 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
388 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  22.84 
 
 
383 aa  134  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
743 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
408 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.35 
 
 
400 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
421 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
394 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  30.33 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  32.08 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
360 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
403 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
413 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
390 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
403 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0402  glycosyltransferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
443 aa  125  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
419 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
435 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  27.48 
 
 
430 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.99 
 
 
769 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
421 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.37 
 
 
377 aa  123  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
377 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
403 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  34.28 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.32 
 
 
393 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1187  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
431 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.18 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
406 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
396 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
441 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  42.62 
 
 
376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
378 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
432 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
396 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
385 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.56 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 
383 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 
380 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.56 
 
 
380 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 
402 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
390 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
507 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.56 
 
 
380 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
390 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
381 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.53 
 
 
373 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
377 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.56 
 
 
380 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
416 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 
380 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  39.32 
 
 
380 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  26.09 
 
 
440 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
381 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
404 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
406 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  28.4 
 
 
393 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
399 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
436 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
438 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>