181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0578 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
526 aa  1053    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.51 
 
 
534 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.83 
 
 
505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.95 
 
 
553 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.05 
 
 
542 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.63 
 
 
762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.47 
 
 
527 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.7 
 
 
618 aa  455  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.48 
 
 
628 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.42 
 
 
534 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.45 
 
 
546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.24 
 
 
772 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.11 
 
 
613 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.07 
 
 
795 aa  435  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.34 
 
 
785 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  51.62 
 
 
614 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.89 
 
 
790 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.8 
 
 
447 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  42.28 
 
 
776 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.26 
 
 
821 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.44 
 
 
609 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.86 
 
 
533 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.65 
 
 
781 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.39 
 
 
775 aa  412  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.64 
 
 
634 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.46 
 
 
905 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  49.1 
 
 
736 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  42.77 
 
 
777 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.59 
 
 
655 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  40.39 
 
 
795 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.06 
 
 
766 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  49.25 
 
 
543 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.17 
 
 
545 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.92 
 
 
774 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.17 
 
 
613 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.73 
 
 
779 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.43 
 
 
605 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.49 
 
 
812 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.81 
 
 
812 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.82 
 
 
760 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  43 
 
 
618 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  42.22 
 
 
469 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.66 
 
 
525 aa  365  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.91 
 
 
765 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.88 
 
 
549 aa  363  5.0000000000000005e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.65 
 
 
422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.71 
 
 
779 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  35.82 
 
 
639 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.66 
 
 
834 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  36.21 
 
 
639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 
665 aa  307  3e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  35.84 
 
 
637 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  36.57 
 
 
602 aa  299  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.83 
 
 
549 aa  295  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.21 
 
 
547 aa  285  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 
529 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.06 
 
 
636 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 
584 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  39.25 
 
 
639 aa  266  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.16 
 
 
816 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.55 
 
 
481 aa  265  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.27 
 
 
688 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.38 
 
 
593 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.09 
 
 
515 aa  262  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.06 
 
 
858 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.62 
 
 
636 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.64 
 
 
639 aa  257  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 
683 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  34.42 
 
 
558 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.45 
 
 
528 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.83 
 
 
688 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.48 
 
 
627 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.24 
 
 
525 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.32 
 
 
794 aa  239  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.27 
 
 
493 aa  237  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.18 
 
 
504 aa  236  7e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.05 
 
 
866 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.51 
 
 
797 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.59 
 
 
673 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.98 
 
 
852 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.09 
 
 
863 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.2 
 
 
673 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.33 
 
 
811 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 
518 aa  219  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.08 
 
 
868 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.39 
 
 
820 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  33.83 
 
 
1140 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.42 
 
 
533 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.38 
 
 
807 aa  207  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.61 
 
 
489 aa  204  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.91 
 
 
778 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.71 
 
 
676 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.36 
 
 
500 aa  199  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.86 
 
 
853 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.91 
 
 
530 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.52 
 
 
884 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.63 
 
 
857 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.88 
 
 
473 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.37 
 
 
885 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  26.55 
 
 
883 aa  170  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>