156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0473 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 522 aa  1029    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  63.16 
 
 		 506 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  56.5 
 
 		 502 aa  548  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  42.57 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  32.84 
 
 		 581 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  28.9 
 
 		 575 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  30.36 
 
 		 628 aa  163  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  23.27 
 
 		 542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  25.95 
 
 		 590 aa  110  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 592 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  27.46 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  25.68 
 
 		 590 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  31.07 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  25.68 
 
 		 590 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  25.68 
 
 		 590 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  25.68 
 
 		 590 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  24.93 
 
 		 592 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 596 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  26.78 
 
 		 591 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  24.59 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  24.11 
 
 		 592 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  24.95 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  24.93 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  24.32 
 
 		 596 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  29.52 
 
 		 542 aa  97.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  29.43 
 
 		 583 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  30.63 
 
 		 543 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  29.27 
 
 		 536 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  25.89 
 
 		 609 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 595 aa  90.1  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  28.78 
 
 		 554 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  22.05 
 
 		 599 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  26.21 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  27.59 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  29.6 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  29.3 
 
 		 593 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  26.57 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  29.35 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  29.35 
 
 		 611 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  29.35 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  29.35 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  28.8 
 
 		 609 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  29.35 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  29.35 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  29.35 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  29.35 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  29.35 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  29.17 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  31.69 
 
 		 624 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  29.35 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  32.24 
 
 		 633 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  30.65 
 
 		 605 aa  72.8  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  29.12 
 
 		 616 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  29.12 
 
 		 616 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  29.67 
 
 		 609 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  31.87 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  32.07 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  28.02 
 
 		 610 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  28.11 
 
 		 607 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  29.28 
 
 		 622 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  30.77 
 
 		 614 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  28.26 
 
 		 611 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  30.22 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  29.89 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  30.22 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  30.77 
 
 		 614 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  30.43 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  27.16 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  30.39 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  32.24 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  30.34 
 
 		 617 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  30.43 
 
 		 601 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  30.43 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  30.43 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  30.77 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  29.89 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  29.89 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  30.43 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  29.89 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  29.89 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  29.89 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  28.8 
 
 		 599 aa  67  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  30.15 
 
 		 630 aa  67  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  28.65 
 
 		 608 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  24.72 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  30.22 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  29.67 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  24.52 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  30.56 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  25.51 
 
 		 591 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  30.6 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  26.9 
 
 		 621 aa  63.9  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  29.19 
 
 		 621 aa  63.9  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  29.35 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  28.57 
 
 		 611 aa  63.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  31.87 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  29.12 
 
 		 611 aa  63.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  30.6 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  27.08 
 
 		 618 aa  63.5  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>