More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0438 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  67.01 
 
 		 217 aa  262  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  58.29 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 201 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 190 aa  88.6  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  34.26 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.66 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  32.65 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  41.07 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 497 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  40.22 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  21.39 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  43.4 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 280 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 180 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1789  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00598195  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>