More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0385 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  100 
 
 		 239 aa  483  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  84.52 
 
 		 239 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  72.69 
 
 		 247 aa  351  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  73.11 
 
 		 238 aa  345  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  75.33 
 
 		 248 aa  345  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3865  ribonuclease PH  74.37 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  72.03 
 
 		 242 aa  337  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  68.62 
 
 		 252 aa  327  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  68.46 
 
 		 252 aa  325  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  67.36 
 
 		 252 aa  325  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  67.78 
 
 		 262 aa  324  7e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  67.23 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  70.12 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  67.36 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  69.87 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0994  ribonuclease PH  68.88 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  73.11 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  67.23 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 237 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 244 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 244 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  71.56 
 
 		 257 aa  311  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 239 aa  309  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  63.18 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  63.18 
 
 		 239 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  71.7 
 
 		 279 aa  305  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  67.51 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 237 aa  304  7e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 238 aa  304  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 246 aa  302  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  68.35 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  64.14 
 
 		 241 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  62.08 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  62.08 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  68.8 
 
 		 260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  61.92 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  61.25 
 
 		 240 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 238 aa  301  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 238 aa  301  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  68.75 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 238 aa  301  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 238 aa  301  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 238 aa  301  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  301  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  63.03 
 
 		 244 aa  301  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 238 aa  299  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  62.92 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 238 aa  298  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  61.25 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  298  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  61.25 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  298  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  62.76 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  62.76 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  60.83 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  60.68 
 
 		 235 aa  295  3e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  60.68 
 
 		 235 aa  295  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  60.5 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 238 aa  295  6e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 238 aa  295  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 238 aa  295  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  295  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  62.5 
 
 		 258 aa  294  7e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 241 aa  294  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>