121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0374 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  55.65 
 
 		 262 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  42.27 
 
 		 556 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  40.26 
 
 		 521 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  34.6 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  36.05 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  36.89 
 
 		 323 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  35.94 
 
 		 234 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  35.27 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  35.19 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  31.06 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  33.33 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  32.03 
 
 		 412 aa  102  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  34.87 
 
 		 192 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  32.59 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.77 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  35.2 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  28.46 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  27.53 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  29.11 
 
 		 238 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  28.63 
 
 		 229 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  30.97 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  30.86 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  28.01 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  29.8 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  30.84 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  30.74 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  27.66 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  31.79 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  30.05 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.21 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.21 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.21 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  29.21 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  29.21 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.21 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  33.53 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.72 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.06 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.71 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  29.94 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  28 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  34.72 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  29.61 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.57 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  27.47 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  36.36 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.43 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  30.47 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  28.3 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.17 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  29.87 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  32.81 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  23.73 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  39.42 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  28.03 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  26.06 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  25.52 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  34.81 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  38.1 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  31.25 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  33.73 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  32.37 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  25.52 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  27.17 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  29.69 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  30.08 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.52 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  25 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.52 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  25 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  30.47 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  27.48 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  36.69 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  34.93 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  28.91 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  28.75 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  27.74 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  29.05 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.91 
 
 		 206 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  25.09 
 
 		 308 aa  52.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  23.7 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  28.12 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  32.39 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.95 
 
 		 198 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  33.66 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  24.73 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  31.72 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  27.32 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  25 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  29.93 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  22.92 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.22 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  27.48 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  35.24 
 
 		 216 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  25.81 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  26.83 
 
 		 377 aa  49.3  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  27.34 
 
 		 293 aa  48.9  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  30.94 
 
 		 395 aa  48.9  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>