More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0373 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  100 
 
 
293 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  61.71 
 
 
284 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  57.61 
 
 
272 aa  253  2e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  59.09 
 
 
272 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  56.92 
 
 
292 aa  239  3e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  54.44 
 
 
308 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  52.53 
 
 
253 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  49.62 
 
 
271 aa  211  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  51.34 
 
 
271 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  54.23 
 
 
266 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  45.38 
 
 
270 aa  201  1e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  49.62 
 
 
274 aa  200  2e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
259 aa  197  2e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  46.95 
 
 
255 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  41.04 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  41.29 
 
 
256 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  46.18 
 
 
255 aa  192  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  1.46988e-14 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  43.51 
 
 
255 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.08332e-07  hitchhiker  8.85497e-15 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 
265 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
272 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  41.76 
 
 
268 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  43.7 
 
 
272 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  42.75 
 
 
288 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  39.47 
 
 
267 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
272 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  43.13 
 
 
255 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.33574e-06  decreased coverage  1.13958e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
272 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  41 
 
 
260 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40.52 
 
 
262 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  41.06 
 
 
254 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.37 
 
 
261 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.31 
 
 
418 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  43.51 
 
 
255 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  9.29505e-13 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  41.44 
 
 
266 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  41.44 
 
 
266 aa  185  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  41.44 
 
 
266 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 
264 aa  185  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  45.42 
 
 
255 aa  184  1e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  42.11 
 
 
265 aa  184  1e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  35.71 
 
 
264 aa  184  1e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.19 
 
 
405 aa  184  1e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 
255 aa  184  2e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  38.55 
 
 
260 aa  184  2e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  45.04 
 
 
255 aa  184  2e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.51345e-05  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  41.57 
 
 
288 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
253 aa  182  4e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.7 
 
 
255 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.7 
 
 
255 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.7 
 
 
255 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 
255 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  40.68 
 
 
259 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.173e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.31 
 
 
255 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 
288 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 
254 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 
290 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  37.79 
 
 
260 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.43522e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.66 
 
 
268 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 
274 aa  180  3e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.37 
 
 
255 aa  179  3e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.38 
 
 
266 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  41.35 
 
 
269 aa  179  5e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.8 
 
 
260 aa  179  5e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.6 
 
 
455 aa  179  6e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.62 
 
 
266 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  43.23 
 
 
269 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.13 
 
 
255 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.62531e-09  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  45.61 
 
 
384 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.31 
 
 
283 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
264 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  39.62 
 
 
259 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  41.76 
 
 
271 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  39.26 
 
 
282 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  45 
 
 
303 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  1.86519e-05 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  46.22 
 
 
263 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  39.08 
 
 
264 aa  175  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40.74 
 
 
258 aa  174  1e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  44.31 
 
 
262 aa  174  1e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  37.93 
 
 
254 aa  174  2e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  41.51 
 
 
273 aa  174  2e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  35.45 
 
 
265 aa  173  2e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39.53 
 
 
269 aa  174  2e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
490 aa  173  3e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.53 
 
 
302 aa  173  3e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.28 
 
 
285 aa  173  4e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  42.32 
 
 
282 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  40.08 
 
 
259 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  39.77 
 
 
414 aa  172  7e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  46.85 
 
 
259 aa  172  7e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  37.98 
 
 
259 aa  172  7e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  39.84 
 
 
269 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  4.77386e-06 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  42.28 
 
 
277 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.28 
 
 
264 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  41.86 
 
 
419 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.77 
 
 
266 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  45.66 
 
 
268 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  38.11 
 
 
264 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0846  ABC transporter related  36.82 
 
 
256 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0869  ABC transporter related  36.82 
 
 
256 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  38.58 
 
 
264 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  42.55 
 
 
279 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>