14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0369 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0369  Htaa domain protein  100 
 
 
630 aa  1220    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  42.86 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2988  Htaa domain protein  39.43 
 
 
994 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360944  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5626  Htaa domain protein  44.44 
 
 
800 aa  123  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35280  Htaa protein  30.56 
 
 
1212 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  40 
 
 
1127 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2877  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.01 
 
 
347 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.651408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  31.79 
 
 
1098 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0370  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.1 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0073  hypothetical protein  35.04 
 
 
270 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2387  hypothetical protein  29.25 
 
 
262 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0074  hypothetical protein  30.3 
 
 
214 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0072  hypothetical protein  32.06 
 
 
332 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2670  hypothetical protein  30.3 
 
 
166 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>