230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0303 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  49.48 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 197 aa  157  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  48.74 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  47.64 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  45.03 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  43.41 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  38.31 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.81 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  36.21 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  35.97 
 
 		 271 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  32.64 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  27.59 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  38.14 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 422 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  22.39 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>