More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0302 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 524 aa  1013    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  57.03 
 
 		 527 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  55.58 
 
 		 529 aa  535  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  57.79 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  57.79 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  57.79 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  56.08 
 
 		 527 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 		 528 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  55.89 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.48 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  57.71 
 
 		 545 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.62 
 
 		 521 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.66 
 
 		 518 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  52.79 
 
 		 521 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  53.55 
 
 		 520 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  51.54 
 
 		 540 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  50.37 
 
 		 550 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  53.69 
 
 		 534 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  50 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  40.36 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.22 
 
 		 533 aa  329  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  34 
 
 		 563 aa  318  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  35.78 
 
 		 583 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.54 
 
 		 568 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  35.93 
 
 		 552 aa  304  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  34.3 
 
 		 554 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.86 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.41 
 
 		 534 aa  299  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  35.09 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.31 
 
 		 557 aa  292  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  37.08 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  36.33 
 
 		 538 aa  287  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.18 
 
 		 565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  42.74 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  32.61 
 
 		 559 aa  282  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  36.63 
 
 		 531 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  37.36 
 
 		 527 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  38.13 
 
 		 532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.41 
 
 		 536 aa  259  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  40.13 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.43 
 
 		 586 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.3 
 
 		 564 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  40.35 
 
 		 532 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.15 
 
 		 535 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  36.11 
 
 		 534 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  35.7 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  33.99 
 
 		 534 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.29 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  36.66 
 
 		 470 aa  226  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.44 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.11 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  33.79 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  34.61 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  35.32 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.57 
 
 		 516 aa  196  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  29.17 
 
 		 554 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.73 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  32.77 
 
 		 513 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.88 
 
 		 523 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  30.2 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  29.95 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  29.95 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  29.46 
 
 		 484 aa  177  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 484 aa  177  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 484 aa  176  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  33.03 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.21 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.26 
 
 		 457 aa  156  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  29.21 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.72 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.95 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.65 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  31.79 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.87 
 
 		 497 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.48 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.55 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.55 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.27 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.55 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.55 
 
 		 497 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.55 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.78 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  30.23 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.86 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  26.86 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.86 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  26.86 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.07 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.07 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  28.22 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.07 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  29.56 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 475 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  28.6 
 
 		 472 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.07 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.65 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>