63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0294 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  55.14 
 
 
324 aa  292  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  36.83 
 
 
339 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  38.01 
 
 
317 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  32.41 
 
 
303 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  33.83 
 
 
324 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  31.54 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  28.92 
 
 
336 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  33.56 
 
 
340 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  34.94 
 
 
349 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  52.63 
 
 
364 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  33.56 
 
 
357 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  24.39 
 
 
358 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  26.67 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  26.52 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  24.73 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  23.78 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  25.09 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  23.43 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  33.06 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  24.56 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  44.68 
 
 
1048 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  26.71 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.22 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  32.74 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  33.88 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  28.35 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  38.04 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  30.16 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  39.08 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  36.69 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  26.7 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.78 
 
 
554 aa  60.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  37.37 
 
 
437 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  37.37 
 
 
437 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  36.25 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.23 
 
 
547 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  37.5 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  37.5 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  37.5 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  23.68 
 
 
366 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  24.06 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  26.49 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  33.59 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  32.03 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  29.46 
 
 
682 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  39.29 
 
 
216 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  39.29 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  31.07 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  31.07 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  32.86 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  25.88 
 
 
327 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  27.75 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  27.93 
 
 
472 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  23.53 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  24.71 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  32.5 
 
 
365 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  32.5 
 
 
365 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  32.5 
 
 
365 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
767 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  31.65 
 
 
364 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  30.85 
 
 
234 aa  42.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  31.65 
 
 
370 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>