More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0290 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  53.45 
 
 		 729 aa  737    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  54.03 
 
 		 714 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  53.65 
 
 		 713 aa  727    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  57.33 
 
 		 708 aa  837    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  52.92 
 
 		 717 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  52.45 
 
 		 722 aa  668    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  57.48 
 
 		 719 aa  822    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  53.18 
 
 		 717 aa  707    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  50.66 
 
 		 729 aa  697    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  53.65 
 
 		 713 aa  727    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  100 
 
 		 770 aa  1502    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  51.06 
 
 		 718 aa  736    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  52.53 
 
 		 726 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  55.18 
 
 		 719 aa  782    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  58.18 
 
 		 710 aa  796    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  52.41 
 
 		 701 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  53.65 
 
 		 713 aa  727    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  48.56 
 
 		 722 aa  628  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  50.78 
 
 		 674 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  51.81 
 
 		 696 aa  612  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  35.48 
 
 		 695 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  34.15 
 
 		 696 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.1 
 
 		 692 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  34.32 
 
 		 682 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  33.38 
 
 		 694 aa  432  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  34.64 
 
 		 670 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  36.36 
 
 		 696 aa  423  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  36.89 
 
 		 680 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  34.73 
 
 		 673 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  36.47 
 
 		 693 aa  423  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  34.37 
 
 		 673 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  41.05 
 
 		 687 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  33.15 
 
 		 695 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  33.97 
 
 		 667 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  37.05 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  36.73 
 
 		 690 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  31.31 
 
 		 696 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  31.04 
 
 		 696 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  33.83 
 
 		 691 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.78 
 
 		 701 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  33.91 
 
 		 690 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  34.24 
 
 		 679 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.07 
 
 		 683 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.37 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  35.62 
 
 		 686 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  32.54 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  40.43 
 
 		 683 aa  402  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  34.77 
 
 		 687 aa  401  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  36.11 
 
 		 707 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  31.26 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  35.44 
 
 		 681 aa  398  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.15 
 
 		 694 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  31.22 
 
 		 693 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  35.57 
 
 		 686 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  35.13 
 
 		 683 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  32.61 
 
 		 694 aa  396  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  31.55 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  34.13 
 
 		 703 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  32.16 
 
 		 697 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  34.9 
 
 		 685 aa  389  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  31.76 
 
 		 697 aa  389  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  32.84 
 
 		 697 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  31.8 
 
 		 701 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.24 
 
 		 692 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  30.83 
 
 		 691 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  35.73 
 
 		 697 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  30.87 
 
 		 691 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  35.59 
 
 		 730 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  35.97 
 
 		 703 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.88 
 
 		 689 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  31.3 
 
 		 682 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  34.85 
 
 		 688 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  33.15 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  32.39 
 
 		 694 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  32.7 
 
 		 688 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  35.05 
 
 		 677 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  32.48 
 
 		 697 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  33.74 
 
 		 699 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  32.89 
 
 		 701 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  31.89 
 
 		 701 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  34.1 
 
 		 687 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  33.47 
 
 		 686 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.26 
 
 		 692 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  32.35 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  35.68 
 
 		 684 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  32.31 
 
 		 698 aa  372  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.27 
 
 		 692 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  30.19 
 
 		 693 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  30.84 
 
 		 690 aa  369  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  32.44 
 
 		 692 aa  366  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  30.18 
 
 		 685 aa  365  2e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  31.9 
 
 		 701 aa  364  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  34.27 
 
 		 688 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  33.6 
 
 		 691 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  31.11 
 
 		 697 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  30.69 
 
 		 697 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.6 
 
 		 691 aa  362  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  32.47 
 
 		 691 aa  361  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  32.31 
 
 		 693 aa  360  5e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  31.32 
 
 		 683 aa  360  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>