114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0193 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  37.16 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  32.42 
 
 
219 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  36.14 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8040  hypothetical protein  35.87 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  32.14 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  34.57 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  35.71 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  34.09 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  34.36 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  33.13 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  37.23 
 
 
257 aa  64.7  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  36.49 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  33.76 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  30.57 
 
 
225 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  29.17 
 
 
209 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  30.14 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  30.49 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  27.52 
 
 
215 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  31.67 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  32.47 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  32.2 
 
 
227 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  32.41 
 
 
188 aa  57.8  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  34.72 
 
 
203 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  29.59 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  33.58 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  30.07 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  33.56 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  31.43 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
218 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  34.03 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  32.34 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  32.17 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  33.1 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  28.74 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  34.03 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  25.77 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  31.36 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  31.13 
 
 
253 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  28.4 
 
 
192 aa  51.2  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  30.3 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  28.36 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1615  protein of unknown function DUF820  29.87 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  28.38 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  32.14 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  28.48 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  29.94 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  23.39 
 
 
202 aa  48.5  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  28.31 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3748  protein of unknown function DUF820  26.82 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956591  normal  0.471613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  31.82 
 
 
203 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.65 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  27.1 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  31.03 
 
 
197 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  25.6 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  31.01 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2429  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  28 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0726  hypothetical protein  24.87 
 
 
208 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.225388  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  30.64 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  29.01 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3923  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  24.05 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1272  protein of unknown function DUF820  27.97 
 
 
209 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  29.87 
 
 
207 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  22.99 
 
 
254 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  22.48 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  31.88 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1616  hypothetical protein  32.91 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00151219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1197  hypothetical protein  28.66 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  27.81 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  30.08 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  29.41 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  29.93 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  22.99 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  28.95 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  26.06 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  27.11 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1187  protein of unknown function DUF820  27.08 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5076  protein of unknown function DUF820  25.71 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  27.11 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  25.69 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  38.81 
 
 
343 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  38.96 
 
 
300 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>