More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0124 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  72.4 
 
 		 263 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 241 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  33.46 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.08 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 286 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  25.65 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.1 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.1 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.23 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1748  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.77 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  37.04 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  25.1 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.1 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.1 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  30.58 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  25.1 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.45 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  25.2 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.22 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  23.83 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.74 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  25.1 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.1 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.21 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  25.21 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.7 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>