More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0111 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  86.34 
 
 
410 aa  696    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  87.1 
 
 
405 aa  699    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
410 aa  835    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  84.69 
 
 
405 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  86.1 
 
 
410 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  71.23 
 
 
368 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  69.05 
 
 
376 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  67.29 
 
 
381 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  68.36 
 
 
381 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  68.53 
 
 
381 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  62.86 
 
 
377 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  62.86 
 
 
377 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  58.2 
 
 
395 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  57.74 
 
 
391 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  62.33 
 
 
375 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  57.22 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  63.13 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  56.53 
 
 
391 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  57.14 
 
 
390 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  56.38 
 
 
403 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  56.45 
 
 
381 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  54.03 
 
 
381 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  55.38 
 
 
408 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  52.91 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  54.67 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  51.08 
 
 
377 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  52.45 
 
 
367 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  52.17 
 
 
367 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  61.49 
 
 
326 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  63.76 
 
 
299 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  51.74 
 
 
406 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  49.38 
 
 
424 aa  352  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  44.62 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  44.62 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  44.62 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  44.62 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  44.35 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  43.32 
 
 
362 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  42.12 
 
 
435 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  43.63 
 
 
393 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  43.35 
 
 
370 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  43.62 
 
 
370 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  42.93 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  42.52 
 
 
384 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  41.6 
 
 
392 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  37.84 
 
 
373 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  38.11 
 
 
373 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  42.58 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  41.05 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  42.58 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  42.58 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  41.05 
 
 
390 aa  273  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  41.05 
 
 
450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  41.05 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  43.09 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  41.23 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  42.3 
 
 
383 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  39.84 
 
 
440 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 
383 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  37.84 
 
 
372 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  37.67 
 
 
372 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  39.24 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  37.3 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  39.51 
 
 
370 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  37.4 
 
 
372 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  41.48 
 
 
392 aa  265  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  40.73 
 
 
394 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  38.96 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  40.9 
 
 
383 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  40.73 
 
 
394 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  40.83 
 
 
383 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  40.83 
 
 
383 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  37.03 
 
 
373 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  37.08 
 
 
383 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  37.03 
 
 
373 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  37.03 
 
 
373 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  37.08 
 
 
383 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  39.24 
 
 
370 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  38.15 
 
 
370 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  39.24 
 
 
370 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  38.96 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  39.51 
 
 
393 aa  262  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  36.76 
 
 
373 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  38.15 
 
 
370 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  39.48 
 
 
416 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  38.57 
 
 
370 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  39.08 
 
 
396 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  36.76 
 
 
373 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  39.59 
 
 
404 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  39.59 
 
 
404 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  41.51 
 
 
385 aa  258  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  42.43 
 
 
384 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  37.06 
 
 
370 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  38.42 
 
 
370 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  40.43 
 
 
385 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  36.62 
 
 
383 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  40.43 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  38.77 
 
 
403 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  38.38 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>