17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0092 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0092  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  948    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  52.07 
 
 		 272 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1422  hypothetical protein  56.05 
 
 		 443 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  51.95 
 
 		 582 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  49.39 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  48.47 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  45.81 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  45.16 
 
 		 514 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1252  hypothetical protein  42.77 
 
 		 371 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0497  hypothetical protein  42.14 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1088  hypothetical protein  47.96 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.348315  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  35.06 
 
 		 2449 aa  53.9  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0779  LasA protease precursor  35.29 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.113695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2144  hypothetical protein  35.29 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00533951  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0869  LasA protease precursor  35.29 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1834  LasA protease precursor  33.82 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.15 
 
 		 1781 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>