14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0089 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0089    100 
 
 		 1257 bp  2492    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  84.26 
 
 		 1944 bp  67.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  97.22 
 
 		 1968 bp  63.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  97.14 
 
 		 1995 bp  61.9  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  91.49 
 
 		 1947 bp  61.9  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  94.44 
 
 		 2001 bp  56  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  89.36 
 
 		 1941 bp  54  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 579 bp  52  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  94.12 
 
 		 1986 bp  52  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  100 
 
 		 1362 bp  50.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  91.89 
 
 		 2019 bp  50.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3219  carbohydrate-binding family V/XII protein  100 
 
 		 2436 bp  48.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  96.43 
 
 		 3198 bp  48.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  90 
 
 		 1947 bp  48.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>