More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0059 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 136 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75.97 
 
 		 134 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75.59 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  70 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  71.77 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  68.46 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  68.46 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  67.69 
 
 		 140 aa  182  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  65.69 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  69.23 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  70.63 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  65.15 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.91 
 
 		 134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  62.88 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  65.32 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.8 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.12 
 
 		 134 aa  174  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  68.03 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  66.94 
 
 		 133 aa  173  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  64.29 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  64.52 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  65.57 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  59.54 
 
 		 140 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75.61 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  64 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  62.9 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  75.61 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  59.09 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  60.48 
 
 		 135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  58.33 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  58.33 
 
 		 134 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  61.6 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.52 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.32 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.2 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.8 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  64.8 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  56.56 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  55.2 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.2 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.2 
 
 		 133 aa  146  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  57.02 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  57.26 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.1 
 
 		 155 aa  140  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  56.45 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  51.67 
 
 		 135 aa  137  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  55.65 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  53.54 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  53.23 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  51.24 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  53.23 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  55.74 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.74 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.74 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.37 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.47 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.92 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  51.2 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.66 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 140 aa  121  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  54.46 
 
 		 680 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  54.55 
 
 		 666 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.7 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  54.13 
 
 		 692 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2208  methylmalonyl-CoA mutase-like  40.77 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000192903  normal  0.0126749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  52.29 
 
 		 670 aa  108  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  49.57 
 
 		 685 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  52.25 
 
 		 714 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  44.95 
 
 		 688 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.89 
 
 		 668 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  49.54 
 
 		 671 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1771  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.54 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1226  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  53.21 
 
 		 672 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6728  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 713 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0223  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  52.17 
 
 		 647 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.784456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.71 
 
 		 657 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.76 
 
 		 1106 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  42.31 
 
 		 738 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  41.98 
 
 		 720 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  46.61 
 
 		 712 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  41.98 
 
 		 722 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0797  methylmalonyl-CoA mutase  48.62 
 
 		 654 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2855  methylmalonyl-CoA mutase  44.95 
 
 		 657 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  40.77 
 
 		 720 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  40.77 
 
 		 720 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  40.77 
 
 		 719 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  41.22 
 
 		 720 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  42.19 
 
 		 716 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  48.21 
 
 		 715 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  44.25 
 
 		 714 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3106  methylmalonyl-CoA mutase  44.04 
 
 		 661 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  39.39 
 
 		 724 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.76 
 
 		 1081 aa  99.4  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 719 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  43.8 
 
 		 712 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>