More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0051 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 546 aa  1075    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  56.82 
 
 		 541 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  56.2 
 
 		 534 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  52.04 
 
 		 562 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  51.31 
 
 		 539 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  47.53 
 
 		 532 aa  465  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  47.71 
 
 		 541 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  46.54 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  44 
 
 		 548 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  44 
 
 		 548 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  44 
 
 		 548 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  43.45 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  46.22 
 
 		 560 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  42.45 
 
 		 530 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  42.86 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  46.17 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  42.21 
 
 		 544 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  42.53 
 
 		 535 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  43.07 
 
 		 550 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  41.28 
 
 		 544 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  45.19 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  42.16 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 		 542 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  43.36 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  39.33 
 
 		 564 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 560 aa  363  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  39.81 
 
 		 574 aa  360  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  39.81 
 
 		 577 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  39.81 
 
 		 577 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  38.11 
 
 		 569 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  41.4 
 
 		 544 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 536 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 518 aa  240  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.89 
 
 		 499 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.76 
 
 		 500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 510 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.16 
 
 		 543 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 508 aa  220  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 524 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.7 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  30.42 
 
 		 515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  30.42 
 
 		 515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.87 
 
 		 497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.87 
 
 		 497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  30.21 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  33.47 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.33 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 516 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 546 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.55 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  28.43 
 
 		 500 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  30.83 
 
 		 517 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.34 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  30.53 
 
 		 527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  30.57 
 
 		 556 aa  198  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  32.47 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  28.36 
 
 		 499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  28.6 
 
 		 500 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  28.04 
 
 		 500 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  27.33 
 
 		 544 aa  196  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 519 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 506 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.02 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 525 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  32.59 
 
 		 504 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  31.02 
 
 		 501 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.3 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 515 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.47 
 
 		 506 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.47 
 
 		 506 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 509 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.74 
 
 		 526 aa  193  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 553 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.06 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  30.51 
 
 		 487 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  27.84 
 
 		 500 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  27.84 
 
 		 500 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  27.97 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  30.82 
 
 		 501 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 515 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  30.82 
 
 		 501 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.8 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.2 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.63 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>