More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0043 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
299 aa  584  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  68.79 
 
 
291 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  47.16 
 
 
295 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4995  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 
308 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  44.76 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2616  alpha/beta hydrolase fold protein  42.55 
 
 
287 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  30.65 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  31.34 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  29.53 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  36.47 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  40.57 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  23.23 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  37.19 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  36.89 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  37.7 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.61 
 
 
2762 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  24.56 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  38.6 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  42.42 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  23.26 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  38.79 
 
 
289 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  38.53 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
324 aa  62.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  36.92 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  42.98 
 
 
3045 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  33.65 
 
 
293 aa  59.3  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  29.9 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  33.16 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  37.11 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  37.76 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  43.3 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  28.8 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2175  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  39.8 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  28.1 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  34.21 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 
248 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 
340 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>