More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0042 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0042  inner-membrane translocator  100 
 
 		 375 aa  718    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0152967  normal  0.0556674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0078  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  72.53 
 
 		 374 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7908  inner-membrane translocator  60.42 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0421  inner-membrane translocator  46.74 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3914  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3800  inner-membrane translocator  38.22 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1383  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 337 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4108  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.98 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  32.11 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 324 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  32.91 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.22 
 
 		 323 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3425  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.18 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 330 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 652 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  32.51 
 
 		 646 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 340 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  35.74 
 
 		 594 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 368 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 304 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.65 
 
 		 646 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.98 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  34.33 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.68 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  33.66 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.69 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  31.63 
 
 		 328 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 351 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  31.63 
 
 		 628 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  33.48 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  34.73 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.22 
 
 		 656 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.46 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2555  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0880453  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  32.34 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  29.54 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.75 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 349 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 328 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>