More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0031 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  100 
 
 
678 aa  1362    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.04 
 
 
688 aa  696    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  70.19 
 
 
686 aa  903    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.04 
 
 
675 aa  728    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.3 
 
 
683 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.83 
 
 
683 aa  800    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.24 
 
 
685 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 
686 aa  770    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.4 
 
 
678 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.41 
 
 
687 aa  727    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.92 
 
 
679 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.18 
 
 
678 aa  705    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.37 
 
 
664 aa  682    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.95 
 
 
674 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.26 
 
 
686 aa  776    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.8 
 
 
684 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  68.26 
 
 
681 aa  886    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.83 
 
 
702 aa  767    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.1 
 
 
678 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 
706 aa  738    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.7 
 
 
691 aa  760    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.57 
 
 
695 aa  681    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.38 
 
 
676 aa  724    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.94 
 
 
690 aa  728    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.44 
 
 
679 aa  715    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.59 
 
 
684 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.32 
 
 
686 aa  684    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.29 
 
 
703 aa  782    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  66.27 
 
 
675 aa  859    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.59 
 
 
684 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.29 
 
 
684 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
686 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.9 
 
 
682 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.02 
 
 
683 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.57 
 
 
683 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.51 
 
 
690 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.29 
 
 
681 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.15 
 
 
681 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.15 
 
 
681 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.15 
 
 
681 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  46.32 
 
 
836 aa  558  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
531 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 
531 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 
531 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
518 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
516 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  43.8 
 
 
523 aa  347  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
519 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  43.36 
 
 
517 aa  334  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
520 aa  325  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  53.67 
 
 
515 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0875  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.15 
 
 
483 aa  120  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
798 aa  114  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  25.26 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  25.26 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  28.28 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  27.83 
 
 
500 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  27.41 
 
 
505 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  29.2 
 
 
517 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2364  aldehyde dehydrogenase  33.22 
 
 
485 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.2 
 
 
500 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0742  aldehyde dehydrogenase  31.01 
 
 
492 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.213961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  28.24 
 
 
505 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  30.33 
 
 
512 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  26.82 
 
 
477 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  28.62 
 
 
475 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.14 
 
 
499 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  30.11 
 
 
494 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  25.52 
 
 
496 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
498 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  27.64 
 
 
478 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  27.11 
 
 
497 aa  105  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.31 
 
 
496 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  24.63 
 
 
475 aa  104  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
491 aa  103  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.11 
 
 
491 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37090  putative aldehyde dehydrogenase  31.85 
 
 
482 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  28.85 
 
 
490 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
504 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
485 aa  103  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  26.38 
 
 
477 aa  103  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  27.23 
 
 
529 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  29.93 
 
 
494 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3062  aldehyde dehydrogenase  32.99 
 
 
485 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  26.1 
 
 
490 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
475 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  29.02 
 
 
483 aa  102  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  30.05 
 
 
474 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
475 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  26.77 
 
 
489 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.869988  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.63 
 
 
499 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  25.78 
 
 
476 aa  101  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2835  lactaldehyde dehydrogenase  26.95 
 
 
474 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  27.69 
 
 
792 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  26.91 
 
 
510 aa  100  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  26.74 
 
 
493 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  26.86 
 
 
490 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.71 
 
 
481 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.51 
 
 
500 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  26.89 
 
 
490 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>