38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0005 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
117 aa  235  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  63.48 
 
 
173 aa  148  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  55.79 
 
 
206 aa  113  7e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  55.34 
 
 
183 aa  112  2e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  51.06 
 
 
179 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  42.99 
 
 
188 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  37.96 
 
 
196 aa  82  2e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  42.86 
 
 
217 aa  81.6  3e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  38.3 
 
 
190 aa  75.1  3e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  38.3 
 
 
190 aa  75.1  3e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  38.3 
 
 
190 aa  75.1  3e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  42.61 
 
 
171 aa  74.3  5e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  37.37 
 
 
173 aa  72.4  2e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  39.36 
 
 
188 aa  72.4  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  38.3 
 
 
185 aa  71.2  4e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  39.42 
 
 
171 aa  71.2  4e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  33.06 
 
 
172 aa  70.5  7e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  36.73 
 
 
196 aa  70.1  9e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  35.11 
 
 
134 aa  68.9  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  37.23 
 
 
187 aa  68.9  2e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  35.11 
 
 
188 aa  67.4  6e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  36.17 
 
 
185 aa  67  8e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.66 
 
 
187 aa  67  9e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  41.49 
 
 
273 aa  66.2  1e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  35.11 
 
 
185 aa  65.9  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  40.86 
 
 
177 aa  65.5  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  32.63 
 
 
166 aa  65.1  3e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  36.19 
 
 
164 aa  65.1  3e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  37.23 
 
 
217 aa  58.9  2e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  34.65 
 
 
207 aa  57  8e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  37.23 
 
 
143 aa  57  9e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  32.98 
 
 
201 aa  55.8  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  31.91 
 
 
180 aa  54.7  4e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  32.98 
 
 
198 aa  54.7  5e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  34.04 
 
 
184 aa  53.1  1e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  33.33 
 
 
266 aa  53.5  1e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  26.6 
 
 
155 aa  50.8  5e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  26.8 
 
 
97 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>