More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0001 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  65.55 
 
 
615 aa  751  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
652 aa  1312  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.01 
 
 
587 aa  604  1e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  75.52 
 
 
480 aa  583  1e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  83.09 
 
 
582 aa  572  1e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  80.87 
 
 
721 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  81.66 
 
 
527 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  74.01 
 
 
570 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  74.78 
 
 
591 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  78.07 
 
 
518 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  71.65 
 
 
534 aa  532  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  77.06 
 
 
490 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  73.62 
 
 
528 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  70.94 
 
 
468 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  72.98 
 
 
577 aa  518  1e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  68.15 
 
 
489 aa  516  1e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  73.68 
 
 
473 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.84064e-14 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  73.13 
 
 
476 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  2.40109e-09  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  72.27 
 
 
562 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  6.90317e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  73.39 
 
 
474 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  3.98294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  74.1 
 
 
527 aa  507  1e-142  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  70.93 
 
 
566 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  66.04 
 
 
495 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  66.04 
 
 
495 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  70.03 
 
 
509 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  66.04 
 
 
495 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  69.85 
 
 
494 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  69.55 
 
 
492 aa  495  1e-138  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  68.22 
 
 
515 aa  494  1e-138  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  69.1 
 
 
557 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  70.15 
 
 
507 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  69.85 
 
 
490 aa  471  1e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.29 
 
 
506 aa  470  1e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  72.62 
 
 
584 aa  471  1e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  67.81 
 
 
565 aa  455  1e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  57.3 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  57.3 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  57.3 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  56.96 
 
 
446 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  57.3 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  57.3 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  56.96 
 
 
446 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  60.65 
 
 
446 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  62.84 
 
 
453 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  56.99 
 
 
446 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  60.36 
 
 
450 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  58.38 
 
 
450 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  58.21 
 
 
443 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  60.65 
 
 
446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  58.46 
 
 
457 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  58.46 
 
 
457 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  60.06 
 
 
446 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.52 
 
 
454 aa  417  1e-115  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  59.23 
 
 
441 aa  417  1e-115  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  57.31 
 
 
440 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.35 
 
 
463 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  60.06 
 
 
450 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  61.27 
 
 
442 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.57 
 
 
446 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  57.61 
 
 
436 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.75 
 
 
443 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.73 
 
 
458 aa  400  1e-110  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  55.16 
 
 
451 aa  400  1e-110  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  52.73 
 
 
453 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.71 
 
 
454 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  60.51 
 
 
443 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  52.73 
 
 
453 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.69 
 
 
444 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  56.97 
 
 
445 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.4 
 
 
449 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.51 
 
 
453 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  50.61 
 
 
470 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  57.32 
 
 
478 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.25 
 
 
439 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  49.48 
 
 
472 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  53.06 
 
 
453 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  51.52 
 
 
500 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  47.58 
 
 
445 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  46.96 
 
 
449 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.38 
 
 
461 aa  362  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  57.32 
 
 
481 aa  361  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.07 
 
 
539 aa  361  3e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.66 
 
 
456 aa  359  1e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.29 
 
 
447 aa  357  3e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  51.04 
 
 
450 aa  357  4e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  56.37 
 
 
480 aa  356  9e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.33 
 
 
439 aa  354  3e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  47.61 
 
 
459 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  48.88 
 
 
482 aa  348  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  50.89 
 
 
460 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  50.78 
 
 
460 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  48.71 
 
 
456 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  50.47 
 
 
458 aa  343  6e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.49 
 
 
503 aa  342  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  50.29 
 
 
453 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  50.29 
 
 
453 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  50.59 
 
 
460 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  46.48 
 
 
454 aa  337  6e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.66 
 
 
469 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  44.86 
 
 
452 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>