More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5413 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  54.88 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  56.96 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.38 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
89 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  46.94 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  65 
 
 
105 aa  85.5  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  54.93 
 
 
97 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  49.25 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  51.76 
 
 
107 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.75 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  50.68 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.16 
 
 
100 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  43.02 
 
 
85 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  43.02 
 
 
85 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  39.52 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  51.56 
 
 
68 aa  82  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  48.72 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 
87 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  55.88 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  47.83 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  46.84 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31960  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.88 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
76 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
76 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  52.17 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  51.35 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  49.3 
 
 
71 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  55.38 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  52.11 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  48.48 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  51.52 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  53.73 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  51.56 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  44.3 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  37.21 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
71 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  52.11 
 
 
214 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  52.86 
 
 
73 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  51.22 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  50.62 
 
 
95 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  47.76 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  35.56 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  54.55 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  41.56 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  41.89 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  44.71 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  45.71 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  52.86 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  51.52 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  48.48 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0822  hypothetical protein  45.76 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.72 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  40.51 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  46.97 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  46.97 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  47.06 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  49.37 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  51.52 
 
 
75 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  50.75 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  45.45 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  45.45 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  46.15 
 
 
83 aa  73.6  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  45.71 
 
 
74 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  45.35 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
73 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2086  hypothetical protein  47.54 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  45.21 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  45.31 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  45.31 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  47.95 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  44.29 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  41.77 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  49.25 
 
 
81 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
72 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>