121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5374 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  56.14 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  51.56 
 
 
226 aa  237  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  51.79 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5534  hypothetical protein  48.03 
 
 
228 aa  218  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789066  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  43.86 
 
 
231 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  41.07 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  40.18 
 
 
224 aa  155  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  37.05 
 
 
224 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  40.44 
 
 
246 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  39.11 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  39.11 
 
 
247 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  38.39 
 
 
225 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  39.11 
 
 
247 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  37.95 
 
 
225 aa  148  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  37.27 
 
 
231 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  36.24 
 
 
227 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  36.64 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  34.38 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  32.88 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  34.22 
 
 
228 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  32.42 
 
 
220 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  32.42 
 
 
220 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  31.82 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0439  protein of unknown function DUF124  34.43 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  31.96 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  33.77 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  31.22 
 
 
221 aa  112  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  30.67 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  30.67 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  33.77 
 
 
225 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  33.77 
 
 
225 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  35.35 
 
 
230 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  31.7 
 
 
250 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  33.48 
 
 
222 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  30.59 
 
 
349 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  33.8 
 
 
232 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  33.03 
 
 
222 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  31.82 
 
 
250 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  28.89 
 
 
232 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  32.13 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  32.33 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  33.67 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  32.39 
 
 
340 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  32.09 
 
 
316 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  33.19 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34460  hypothetical protein  29.89 
 
 
174 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.727592  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  32 
 
 
229 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  33.19 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  26.15 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  33.77 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  31.6 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  33.77 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  32.9 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  32.22 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02993  DUF124 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08610)  30.95 
 
 
373 aa  78.6  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29967  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  27.66 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  30.53 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  26.61 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  27.52 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  30.56 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  31.25 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  27.01 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  28.08 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  28.29 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  29.72 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  29.39 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  30.84 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  27.78 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  27.06 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  28.76 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  28.38 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  31 
 
 
277 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  30.57 
 
 
275 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  28.33 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  26.7 
 
 
224 aa  62  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  32.19 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  26.91 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  28.83 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  28.83 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  27.73 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  28.83 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  27.43 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  29.87 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  28.83 
 
 
260 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  28.83 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  28.83 
 
 
260 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  29.87 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  28.26 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  29.57 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  31.9 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  28.82 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  28.38 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  30.6 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  28.82 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  28.38 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  28.15 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>