More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5363 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  60.48 
 
 
772 aa  916    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  53.59 
 
 
1118 aa  755    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  100 
 
 
832 aa  1691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  57.46 
 
 
782 aa  893    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  50.17 
 
 
865 aa  810    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  53.29 
 
 
824 aa  804    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  57.46 
 
 
782 aa  893    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  64.1 
 
 
879 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  64.52 
 
 
863 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  61.89 
 
 
871 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  75.43 
 
 
749 aa  452  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  60.61 
 
 
939 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  33.17 
 
 
821 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  33.1 
 
 
807 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  80.53 
 
 
459 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  32.53 
 
 
831 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  77.43 
 
 
460 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  74.34 
 
 
469 aa  365  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  73.42 
 
 
461 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  74.78 
 
 
457 aa  353  8e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  73.89 
 
 
451 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  73.33 
 
 
453 aa  351  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  73.01 
 
 
454 aa  348  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  73.04 
 
 
460 aa  347  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  72.61 
 
 
448 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  72.12 
 
 
455 aa  344  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  72.61 
 
 
464 aa  344  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  71.56 
 
 
457 aa  342  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  71.68 
 
 
449 aa  340  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  64.45 
 
 
460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  70.8 
 
 
452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  64.31 
 
 
461 aa  336  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  71.24 
 
 
464 aa  335  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  69.03 
 
 
462 aa  331  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  69.96 
 
 
874 aa  331  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  70.93 
 
 
452 aa  329  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  61.15 
 
 
480 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  67.7 
 
 
468 aa  323  7e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  68.28 
 
 
452 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  68.14 
 
 
474 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  67.73 
 
 
844 aa  303  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  67.71 
 
 
903 aa  299  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  62.67 
 
 
509 aa  287  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  62.67 
 
 
481 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  49.18 
 
 
449 aa  245  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  47.58 
 
 
441 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.33 
 
 
445 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  48.15 
 
 
449 aa  240  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  46.67 
 
 
442 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  48.23 
 
 
444 aa  237  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  47.33 
 
 
446 aa  235  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  46.64 
 
 
442 aa  233  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  46.34 
 
 
481 aa  233  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  48.25 
 
 
470 aa  229  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  44.44 
 
 
481 aa  228  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  45.68 
 
 
454 aa  228  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  49.17 
 
 
471 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  46.72 
 
 
449 aa  227  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  48.23 
 
 
447 aa  227  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  44.32 
 
 
450 aa  227  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  43.24 
 
 
440 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  49.78 
 
 
454 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.5 
 
 
454 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5914  replicative DNA helicase  47.6 
 
 
453 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  49.34 
 
 
444 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.8 
 
 
448 aa  224  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  49.34 
 
 
439 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  46.5 
 
 
460 aa  224  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.58 
 
 
444 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
318 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  42.91 
 
 
453 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  51.97 
 
 
441 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  45.23 
 
 
453 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  42.91 
 
 
449 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
453 aa  221  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
453 aa  221  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
453 aa  221  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
453 aa  221  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
453 aa  221  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  47.58 
 
 
459 aa  221  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
453 aa  221  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
453 aa  221  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  47.9 
 
 
456 aa  221  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  41.44 
 
 
471 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  43.75 
 
 
471 aa  219  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  43.75 
 
 
471 aa  219  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  43.57 
 
 
476 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  46.12 
 
 
509 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  43.57 
 
 
476 aa  218  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  46.64 
 
 
456 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  47.39 
 
 
443 aa  217  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  45.45 
 
 
456 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  47.08 
 
 
458 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  44.63 
 
 
460 aa  216  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  44.63 
 
 
460 aa  216  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  44.77 
 
 
465 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.32 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
445 aa  216  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  45.53 
 
 
525 aa  215  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  45.27 
 
 
456 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>