68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5329 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  943    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  44.86 
 
 
419 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  43.71 
 
 
477 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  43.48 
 
 
412 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  42.6 
 
 
477 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  43.03 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  44.15 
 
 
410 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  36.01 
 
 
469 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  34.14 
 
 
427 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  32.38 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  36.39 
 
 
444 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.45 
 
 
414 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  30.32 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  34.43 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  30.32 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  30.32 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  31.8 
 
 
395 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  30.13 
 
 
430 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  33.22 
 
 
426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  31.11 
 
 
428 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  33.23 
 
 
417 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  35.36 
 
 
408 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  33.96 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  34.17 
 
 
437 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.54 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.54 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.54 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.23 
 
 
570 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  33.54 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.83 
 
 
479 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  32.75 
 
 
421 aa  116  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  30.95 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  31.48 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  33.22 
 
 
408 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  32.13 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  29.97 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  31.67 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  32.32 
 
 
438 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  32.32 
 
 
438 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  32.32 
 
 
438 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  32.28 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  29.97 
 
 
494 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  29.59 
 
 
467 aa  108  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  30.05 
 
 
398 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  29.89 
 
 
417 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  29.89 
 
 
417 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  34.66 
 
 
422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.61 
 
 
455 aa  103  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  34.66 
 
 
422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  38.97 
 
 
429 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.48 
 
 
411 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  34.66 
 
 
422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  35.86 
 
 
378 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  33.93 
 
 
470 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  29.19 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  29.19 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  29.19 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  30.43 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  28.84 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  24.85 
 
 
734 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  27.27 
 
 
429 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  29.63 
 
 
468 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  25 
 
 
469 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2630  hypothetical protein  27.6 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2488  putative integral membrane protein  30 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59815  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1213  Protein of unknown function DUF2029  25.08 
 
 
427 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0404366  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  27.97 
 
 
430 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1662  hypothetical protein  27.05 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>