More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5243 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  52.2 
 
 		 709 aa  641    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  100 
 
 		 730 aa  1440    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  52.2 
 
 		 709 aa  641    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  52.2 
 
 		 709 aa  641    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  48.47 
 
 		 710 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  48.51 
 
 		 726 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  49.13 
 
 		 715 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  44.54 
 
 		 711 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  32.6 
 
 		 770 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  36.7 
 
 		 762 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  42 
 
 		 817 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  29.76 
 
 		 771 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.28 
 
 		 371 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.48 
 
 		 674 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.68 
 
 		 370 aa  181  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.99 
 
 		 387 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  26.12 
 
 		 351 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  23.57 
 
 		 684 aa  97.8  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  26.07 
 
 		 989 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  26.88 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  24.6 
 
 		 968 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  29.25 
 
 		 343 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  28.25 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1006 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.17 
 
 		 372 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.628178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  35.51 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  28.83 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.64 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.74 
 
 		 267 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  33.57 
 
 		 295 aa  66.6  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.59 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  30.9 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.34 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  30.37 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.85 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.59 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.85 
 
 		 267 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  32.17 
 
 		 300 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  28.95 
 
 		 343 aa  62  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.92 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  33.1 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.38 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  29.49 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  37.04 
 
 		 291 aa  60.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  30.71 
 
 		 672 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  27.44 
 
 		 380 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.16 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.33 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.71 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.2 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0912  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.02 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  27.04 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  27.34 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.46 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315425  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.71 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.71 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.68 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  26.84 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  23.02 
 
 		 330 aa  57  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.82 
 
 		 253 aa  57  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3716  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.47 
 
 		 354 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.51 
 
 		 261 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.76 
 
 		 249 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.11 
 
 		 255 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2513  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.17 
 
 		 219 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693793  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.48 
 
 		 283 aa  56.2  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  29.35 
 
 		 343 aa  56.6  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.88 
 
 		 257 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  27.37 
 
 		 343 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  28.72 
 
 		 342 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.11 
 
 		 255 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.68 
 
 		 347 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.26 
 
 		 268 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.41 
 
 		 270 aa  55.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  31.87 
 
 		 349 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.03 
 
 		 255 aa  55.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.92 
 
 		 255 aa  55.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  29.15 
 
 		 315 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3072  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 		 267 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  28.43 
 
 		 335 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.22 
 
 		 252 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.62 
 
 		 215 aa  55.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  27.84 
 
 		 252 aa  55.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.65 
 
 		 284 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.48 
 
 		 295 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0613  adenylyltransferase  31.97 
 
 		 248 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.52 
 
 		 251 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.86 
 
 		 254 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  26.9 
 
 		 203 aa  54.3  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.9 
 
 		 256 aa  54.3  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>