More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5156 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 479 aa  955    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  69.37 
 
 		 461 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  64.35 
 
 		 460 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  51.09 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  50.11 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.34 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  51.82 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.26 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.69 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  48.19 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  49.12 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.71 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.71 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.71 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  43.45 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  44.06 
 
 		 462 aa  356  5.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.33 
 
 		 453 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.56 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.74 
 
 		 470 aa  352  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.09 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.87 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.87 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.65 
 
 		 470 aa  347  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.87 
 
 		 470 aa  347  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.87 
 
 		 470 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.65 
 
 		 470 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.65 
 
 		 470 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.79 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  41.83 
 
 		 462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  41.7 
 
 		 457 aa  342  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.53 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.14 
 
 		 459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.53 
 
 		 469 aa  336  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.7 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  45.2 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  41.05 
 
 		 466 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  41.14 
 
 		 459 aa  333  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  45.22 
 
 		 470 aa  329  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.26 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.93 
 
 		 449 aa  326  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.56 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  44.19 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.61 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.18 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.67 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  41.18 
 
 		 459 aa  319  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.98 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  40.31 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 		 456 aa  317  4e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  41.61 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  39.96 
 
 		 461 aa  316  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  44.82 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.88 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.98 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.35 
 
 		 460 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.12 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.52 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.15 
 
 		 460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.74 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  40.84 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.14 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.26 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  37.34 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.52 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.1 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.3 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.77 
 
 		 460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.77 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.77 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  40.61 
 
 		 458 aa  302  9e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.8 
 
 		 461 aa  302  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  39.3 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.65 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.96 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.7 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  40.72 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  39.08 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  37.83 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  39.08 
 
 		 462 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.87 
 
 		 473 aa  295  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  42.05 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  38.6 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  37.8 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.26 
 
 		 493 aa  292  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.18 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  38.65 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.75 
 
 		 479 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  44.72 
 
 		 447 aa  289  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.07 
 
 		 484 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.8 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  38.27 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.69 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  36.7 
 
 		 499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  38.43 
 
 		 499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  43.23 
 
 		 506 aa  287  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>