More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4977 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  52.53 
 
 		 220 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  54.34 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  54.34 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  54.34 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  52.53 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  54.29 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  54.25 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  54.25 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  47.2 
 
 		 214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  48.82 
 
 		 217 aa  197  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  47.27 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  48.64 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  47.44 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  49.52 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  53.77 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  47.64 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  50.24 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  45.28 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  44.24 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  43.6 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  42.47 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  41.7 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  43.13 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.59 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  41.55 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.71 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  46.92 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  38.86 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  43.36 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  38.1 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.86 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  29.3 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  30.16 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  28.24 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.92 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00632575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0608  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.44 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00182216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  30.8 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  29.56 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  30.65 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  26.63 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.82 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.67 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  34.57 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  27.57 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  27.4 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  28.44 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  31.68 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  30.8 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.72 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  33.88 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  30.62 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  23.58 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1920  phosphate uptake regulator, PhoU  26.03 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  32.58 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  25.23 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  28.7 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  32.76 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  32.63 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  30.59 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  26.76 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  28.11 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.7 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  29.68 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  30.96 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  32.44 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  26.89 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>