More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4939 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  100 
 
 		 404 aa  787    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  45.11 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  46.8 
 
 		 423 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  47.25 
 
 		 421 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.24 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  42.47 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.33 
 
 		 401 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.74 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.02 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.39 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.29 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  39.36 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  41.79 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  41.03 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  42.47 
 
 		 399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  37.97 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  38.92 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  38.48 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  38.6 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  39.85 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  38.34 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  39.36 
 
 		 429 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.81 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  37.13 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  39.64 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  37.18 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  39.6 
 
 		 423 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.83 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  36.76 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  42.64 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  41.28 
 
 		 398 aa  222  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  38.64 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.11 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  40.05 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  38.48 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  39.66 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  35.73 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  37.4 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  37.31 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  42.77 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.08 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.58 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  41.11 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.83 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.14 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.52 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.08 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.59 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.14 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.14 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.83 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  39.78 
 
 		 423 aa  215  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  39.95 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  38.76 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.76 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.71 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.25 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  37.88 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  37.72 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  40.21 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.38 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  42.05 
 
 		 414 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  40.55 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  42.47 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  33.11 
 
 		 442 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  36.21 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  38.87 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.97 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.12 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  33.6 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  36.36 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  40.25 
 
 		 443 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  38.7 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  41.03 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  38.7 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.25 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  35.29 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  42.9 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  38.7 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.37 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  37.01 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  39.79 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.18 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.91 
 
 		 410 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  41.12 
 
 		 450 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.51 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.47 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.07 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.81 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  38.01 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  35.04 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  35.63 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  39.32 
 
 		 444 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.97 
 
 		 412 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.84 
 
 		 410 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>