61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4859 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  100 
 
 
327 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  45.28 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  42.81 
 
 
293 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  41.22 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  39.62 
 
 
269 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  38.46 
 
 
287 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  38.46 
 
 
287 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  37.84 
 
 
274 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  41.98 
 
 
289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  37.93 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  39.15 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  38.85 
 
 
273 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  39.47 
 
 
297 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  39.15 
 
 
278 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  39.92 
 
 
280 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  39.92 
 
 
294 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  37.3 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  37.72 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  39.69 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  36.75 
 
 
291 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  36.54 
 
 
284 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  35.38 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  36.4 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  36.47 
 
 
278 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  37.45 
 
 
281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  35.45 
 
 
284 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  31.52 
 
 
289 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  30.22 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  31.8 
 
 
611 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  32.12 
 
 
458 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  35.36 
 
 
587 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  30.04 
 
 
317 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  27.2 
 
 
291 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  31.87 
 
 
474 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  27.05 
 
 
295 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  27.05 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  27.68 
 
 
346 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  31.84 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  25.35 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  29.61 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  28.87 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  28.93 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  29.23 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  27.31 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  36.17 
 
 
234 aa  57  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  29.53 
 
 
229 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  27.64 
 
 
559 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  23.47 
 
 
232 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  25.98 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  28.31 
 
 
348 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  22.97 
 
 
232 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  23 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  23.7 
 
 
232 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  23 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  23 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  23 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  23 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  23 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  23.7 
 
 
232 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  23.74 
 
 
232 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  25 
 
 
248 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>