132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4813 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  100 
 
 
723 aa  1452  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  55.18 
 
 
346 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  43.43 
 
 
905 aa  321  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  42.86 
 
 
839 aa  315  2e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  44.78 
 
 
850 aa  283  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  42.94 
 
 
844 aa  275  2e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  39.4 
 
 
877 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  35.15 
 
 
852 aa  254  4e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  36.47 
 
 
857 aa  226  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  27.71 
 
 
556 aa  154  6e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  27.6 
 
 
556 aa  141  4e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
1118 aa  141  4e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  27.6 
 
 
556 aa  141  4e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 
1132 aa  140  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.26 
 
 
859 aa  131  5e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.26 
 
 
859 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.41179e-10 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  24.56 
 
 
861 aa  129  2e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  24.56 
 
 
861 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  24.26 
 
 
858 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  24.56 
 
 
861 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  24.56 
 
 
861 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.56 
 
 
861 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88659e-07 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  24.56 
 
 
861 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.26 
 
 
861 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  24.76 
 
 
568 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  23.96 
 
 
861 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  29.25 
 
 
854 aa  119  2e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  26.64 
 
 
863 aa  114  8e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  25.81 
 
 
847 aa  112  2e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  26.1 
 
 
863 aa  111  4e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  23.46 
 
 
861 aa  110  8e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.17 
 
 
872 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  25.4 
 
 
854 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  21.68 
 
 
851 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  21.68 
 
 
851 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  26.07 
 
 
590 aa  107  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 
1113 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  23.3 
 
 
813 aa  105  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  25.65 
 
 
870 aa  104  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  21.88 
 
 
861 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  27.52 
 
 
850 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  28.57 
 
 
880 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  25.16 
 
 
867 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  26.47 
 
 
578 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  28.32 
 
 
880 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  27.24 
 
 
880 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  28.32 
 
 
880 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.38 
 
 
844 aa  102  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  27.14 
 
 
879 aa  102  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  26.67 
 
 
880 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  24.84 
 
 
867 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  24.12 
 
 
851 aa  100  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  20.92 
 
 
840 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  20.92 
 
 
840 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  26.94 
 
 
896 aa  99.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  20.43 
 
 
862 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  27.34 
 
 
880 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  20.49 
 
 
840 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  22.98 
 
 
569 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  24.24 
 
 
872 aa  98.2  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  23.3 
 
 
395 aa  97.8  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  26.52 
 
 
869 aa  97.8  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  26.06 
 
 
875 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  26.03 
 
 
701 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.44 
 
 
877 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  23.87 
 
 
880 aa  95.5  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  23.87 
 
 
880 aa  95.1  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  25.23 
 
 
597 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  27.9 
 
 
881 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  24.45 
 
 
1100 aa  94  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  27.94 
 
 
876 aa  94  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  27.9 
 
 
881 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  22.43 
 
 
1120 aa  92.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  25.68 
 
 
850 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  25.97 
 
 
855 aa  91.3  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  25.68 
 
 
850 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.74946e-06 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 
1138 aa  90.9  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  21.47 
 
 
875 aa  90.9  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  24.04 
 
 
1101 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  24.14 
 
 
592 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  23.06 
 
 
429 aa  88.2  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.72 
 
 
883 aa  88.2  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  25.34 
 
 
850 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0534  protein of unknown function DUF472  26.33 
 
 
454 aa  87.4  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 
1112 aa  86.7  1e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  20.82 
 
 
917 aa  87  1e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 
1111 aa  87  1e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  23.03 
 
 
1094 aa  86.7  1e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 
1112 aa  86.7  1e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  25.63 
 
 
346 aa  86.7  2e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  25.58 
 
 
938 aa  85.9  2e-15  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  24.6 
 
 
877 aa  85.9  2e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  24.6 
 
 
877 aa  85.9  2e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  24.73 
 
 
871 aa  86.3  2e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  24.73 
 
 
871 aa  85.9  3e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  24.27 
 
 
1098 aa  84.3  8e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  23 
 
 
643 aa  83.6  1e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  24.13 
 
 
557 aa  83.6  1e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  23.96 
 
 
864 aa  83.2  2e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  23.05 
 
 
866 aa  81.3  6e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>