228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4801 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
212 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  54.23 
 
 
201 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  54.25 
 
 
221 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  54.25 
 
 
221 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  54.25 
 
 
221 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  55.22 
 
 
235 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  52.28 
 
 
233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  50.99 
 
 
203 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  50.73 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  48.24 
 
 
205 aa  177  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  50.5 
 
 
539 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  48.76 
 
 
522 aa  171  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  48.26 
 
 
531 aa  168  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  45.77 
 
 
541 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  45.77 
 
 
553 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  46.27 
 
 
549 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  47.76 
 
 
555 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  48.51 
 
 
536 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  55.69 
 
 
222 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  46.27 
 
 
534 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.5 
 
 
562 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  49.01 
 
 
209 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  46.27 
 
 
217 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  43.56 
 
 
518 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  49.01 
 
 
203 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  45.41 
 
 
248 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  44.81 
 
 
219 aa  151  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  43.5 
 
 
204 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  47.5 
 
 
200 aa  148  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  45.81 
 
 
203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  44.13 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  41.46 
 
 
539 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  44.55 
 
 
218 aa  138  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  47.03 
 
 
203 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.59 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  40.85 
 
 
217 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  43.18 
 
 
218 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  43.18 
 
 
218 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  40.09 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  43.18 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 
217 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  42.27 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  40.72 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  42.08 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  41.63 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  40.85 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  54.47 
 
 
564 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.93 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  40.65 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  39.63 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  40.65 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  44 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  40.65 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  40.65 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.65 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.65 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  59.29 
 
 
510 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  39.25 
 
 
215 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  42.08 
 
 
539 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  41.36 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  33.64 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  41.24 
 
 
592 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  42.99 
 
 
258 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  35.02 
 
 
218 aa  124  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  38.14 
 
 
215 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  38.14 
 
 
215 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  36.41 
 
 
218 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  35.35 
 
 
228 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  36.53 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  36.49 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  36.53 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  36.15 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  37.79 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  37.79 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  37.79 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  40.38 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  37.79 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  39.66 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  43.32 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  37.79 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  36.87 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  38.25 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  37.79 
 
 
218 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  37.79 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  43.96 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  40.87 
 
 
225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  38.5 
 
 
218 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  34.26 
 
 
229 aa  118  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  47.66 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  47.66 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  38.24 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  35.85 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  36.15 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  44.88 
 
 
571 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  40.38 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  44.88 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  35.48 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  38.86 
 
 
233 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  35.48 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  35.48 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>